Theo đó, ngoài các trường hợp bị từ chối nêu tại Thông tư số 38/2018/TT-BTC ngày 20/4/2018, chứng từ chứng nhận xuất xứ hàng hóa sẽ bị từ chối trong các trường hợp sau:

- Người khai hải quan không khai số tham chiếu, ngày cấp hoặc chưa có chứng từ chứng nhận xuất xứ tại thời điểm làm thủ tục hải quan mà không khai chậm nộp trên tờ khai hải quan nhập khẩu;

- Người khai hải quan khai chậm nộp chứng từ chứng nhận xuất xứ hàng hóa nhưng khai bổ sung và nộp chứng từ quá thời hạn;

Ngoài ra, Thông tư còn bổ sung việc xác định xuất xứ hàng hóa xuất nhập khẩu để áp dụng thuế suất ưu đãi đặc biệt trong khuôn khổ Hiệp định Đối tác Toàn diện và Tiến bộ xuyên Thái Bình Dương:

- Phải có đủ thông tin tối thiểu như người xuất khẩu hoặc người sản xuất; Tên, địa chỉ (gồm quốc gia), số điện thoại và địa chỉ email của người chứng nhận…

- Khi từ chối áp dụng thuế suất ưu đãi đặc biệt, cơ quan hải quan thông báo lý do bằng văn bản cho người nhập khẩu biết…

Thông tư này có hiệu lực từ ngày 21/10/2019.